salome_meca-2023メモ

ダウンロード†

Salome-Meca-Code_Asterのサイトが、最近、証明書の期限切れで接続できなくなっている。（2024/8/26現在は表示できるようになった。証明書を新しくしたのだろうか。） Chromiumブラウザーか、Firefoxの古い(76.0以前とか)なら、サイトの表示はできるかもしれないが、ダウンロードしようとすると、証明書の期限切れで続行できなくなる。wgetで --no-check-certificate オプションを試してみる。

wget -e HTTP_PROXY=hogeproxy.hoge.jp:8080 'https://code-aster.org/FICHIERS/singularity/salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10.sif' --no-check-certificate

途中で切れたら

wget --continue -e HTTP_PROXY=hogeproxy.hoge.jp:8080 'https://code-aster.org/FICHIERS/singularity/salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10.sif' --no-check-certificate

100%になるまで、これを何回でも繰り返す。 sha1sumとmd5sumの結果は以下のようになる。Code_Asterのサイトにのっているsha1/md5の欄の数値とは違うが...

$ sha1sum salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10.sif
1285faa4aef8e94a39a32613a04b32567e2d60a4  salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10.sif

$ md5sum salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10.sif
6f38474fab9253a5adf5f02887b8126d  salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10.sif

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singularityのインストール†

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Ubuntu24†

Ubuntu24でのsingularityのインストールは、

sudo apt install singularity-container singularity

これだけで大丈夫のよう。

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実行ファイルの作成†

$ singularity run --app install salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10.sif

を実行すると、salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10.sif という実行ファイルができている。実行方法は、

$./salome_meca/salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10 --soft

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パネルにアイコンを追加†

パネル上で右クリックし「パネルへ追加」
カスタム・アプリケーションのランチャ
追加
名前：Salome-Meca2023
コマンド：/home/kouzou/salome_meca/salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10 --soft
アイコンの画像は、何もしないと押ボタンになるけど、今までのアイコンがよければ、それをsalome_mecaのディレクトリにでも入れて、参照すればよい。
- 例えば、Salome-Meca2020のアイコンの画像ファイルは、~/kouzou/salome_meca/V2020.0.1_universal_universal/icon.png

Salome-Meca2022の場合は
- コマンド：/usr/bin/singularity run /home/kouzou/salome_meca/salome_meca-lgpl-2022.1.0-1-20221225-scibian-9.sif

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以下は、うまく行かなかったときの記録†

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実行ファイルをつくらないとうまくいかない†

ubuntu24またはubuntu22上のsalome23で、kata.hdf, kata.commを動かすと、以下のエラー。

Summary
Output messages for stage kata


Output messages for stage kata - [top / bottom]

++ using container salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10.sif
++ using software rendering mode (should use `mesa_salome` starter)

ubuntu22では動くsalome22は、ubuntu24では起動すらしないので、ターミナルから実行すると、以下のエラー

$ /usr/bin/singularity run /home/kouzou/salome_meca/salome_meca-lgpl-2022.1.0-1-20221225-scibian-9.sif
FATAL:   container creation failed: mount /proc/self/fd/3->/var/lib/singularity/mnt/session/rootfs error: while mounting image /proc/self/fd/3: kernel reported a bad superblock for squashfs image partition, possible causes are that your kernel doesn't support the compression algorithm or the image is corrupted

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試行錯誤したメモ†

ここにあるように、

$ singularity run --app install salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10.sif

を実行すると、

Installation successfully completed.
To start salome_meca, just use:
  /home/gthmhk/salome_meca/salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10
or (in the installation directory):
  ./salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10

If you want to check your configuration, use:
  singularity run --app check salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10.sif

と表示されて、salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10 という実行ファイルができる。これを実行すると、以下のエラー。

/home/kouzou/salome_meca/./salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10:433: SyntaxWarning: invalid escape sequence '\.'
  regexp = re.compile("hwloc_(.*)\.so")
+ running salome_meca in GPU mode
++ using container salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10.sif
++ prepend system 'libGL*' libs
SALOME_Session_Server_No_Server: /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6: version `GLIBC_2.38' not found (required by /.singularity.d/libs/libGLdispatch.so.0)
SALOME_Session_Server_No_Server: /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6: version `GLIBC_2.34' not found (required by /.singularity.d/libs/libGLdispatch.so.0)
SALOME_Session_Server_No_Server: /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6: version `GLIBC_2.38' not found (required by /.singularity.d/libs/libGLX.so.0)
SALOME_Session_Server_No_Server: /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6: version `GLIBC_2.34' not found (required by /.singularity.d/libs/libGLX.so.0)

末尾に --soft のオプションをつけて以下のように実行したら、Salome-Mecaが起動する。

$./salome_meca-lgpl-2023.1.0-4-20240327-scibian-10 --soft

kata.hdfとkata.commとで動作を確認。よかった、よかった。